|
ДокладыМолекулярно-динамическое моделирование нуклеосом, содержащих вариантный гистон H2A.JМГУ им. М.В. Ломоносова, биологический факультет, кафедра биоинженерии, г. Москва, Ленинские горы, 1/73, 119234. Тел. +79771008459. n.kosarim@intbio.org Эукариотическая ДНК хранится в клеточном ядре в виде комплекса с гистонами — белками, имеющими несколько вариантов, которые играют различные роли в клеточных процессах. В частности, один из вариантных гистонов под названием H2A.J предположительно связан со старением и раком [1]. Однако, на сегодняшний день молекулярные механизмы, определяющие подобную роль H2A.J, не ясны. Кристаллографический анализ структур нуклеосом, содержащих H2A.J, также не объяснил его экспериментально обнаруженные особенности и функциональную роль в составе нуклеосомы [2], что демонстрирует динамическую природу данных механизмов. Для исследования механизмов влияния H2A.J на структуру и динамику нуклеосомы мы использовали метод молекулярной динамики (МД), с помощью которого получили атомистические траектории полноразмерных нуклеосом, содержащих канонический гистон H2A, а также обычный и фосфорилированный H2A.J. Проанализировав внутреннюю динамику нуклеосом в полученных траекториях, мы смогли предложить молекулярный механизм, объясняющий повышенную термостабильность нуклеосом, содержащих H2A.J по сравнению с каноническими нуклеосомами. Также мы сравнили связывание C-концевых хвостов канонического H2A и H2A.J с ДНК и продемонстрировали роль фосфорилирования H2A.J в этом процессе. Работа поддержана грантом РНФ № 19-74-30003-П https://rscf.ru/project/23-74-33002/. Работа выполнена с использованием оборудования Центра коллективного пользования сверхвысокопроизводительными вычислительными ресурсами МГУ имени М.В. Ломоносова.
Литература
Материалы доклада |
