English
!

Доклады

Особенности распределения пространственной частоты изменения электростатического потенциала вокруг геномной ДНК бактериофага T7 в области промоторов, специфичных для нативной фаговой и хозяйской РНК полимеразы E.coli

Глытов И.В., Осипов А.А.1

Институт теоретической и экспериментальной биофизики РАН

1Институт высшей нервной деятельности и нейрофизиологии РАН

Целью данной работы было выявление различий между частотными характеристиками заряда молекулы ДНК фага Т7 в области его нативных и хозяйских (E.coli) промоторов. В качестве инструмента для анализа было выбрано вейвлет-преобразование с использованием вейвлета Морле. Сравнение вейвлет-спектров фаговых и бактериальных промоторов между собой показало, что мощность сигнала в области хозяйских промоторов в диапазоне 10-15 Гц (длина волны 20-30 Ангстрем) выше таковой в области фаговых в 7-8 раз, а также что мощность частот в диапазоне 2-4 Гц (длина волны 75-150 Ангстрем) в среднем по всему геному меньше таковой в промоторных областях в 1.5 раза и что частоты в диапазоне 10-15 Гц в геноме аналогичны по мощности таковым в области хозяйских промоторов. Высокая мощность в диапазоне 2-4 Гц оказалась одинаково характерна как для бактериальных, так и для вирусных промоторов.

Материалы доклада

© 2004 Дизайн Лицея Информационных технологий №1533