|
ДокладыК систематике хромосом человекаИнститут биофизики клетки РАН, 142290 Пущино, Московская обл., Россия Масштабные успехи в полногеномном секвенировании разнообразных видов организмов эукариот позволяют в настоящее время существенно углубить имеющиеся представления о важной и нетривиальной роли неравноправного участии нуклеотидных последовательностей (треков) из АТ- и GC- Уотсон-Криковских пар в структурно-функциональной организации геномной ДНК. Они также дают возможность, на наш взгляд, развить и некоторые новые положения в систематике хромосом, основанные на выявляемой корреляции между характером точечных спонтанных мутаций в разных хромосомах и особенностями организации структуры коротких нуклеотидных G/C треков в составе их белок-кодирующих областей. Основная цель данной работы проиллюстрировать как, используя методы сравнительной геномики, в кариотипе человека возможно ранжирование хромосом по GC(%)-составу экзонов своих белок-кодирующих областей и с учетом протяженности доминирующих в них коротких oligo(G)n -, oligo(С)n - и S(G/C)n – треков. В качестве ключевого фактора в организации данной зависимости рассматривается влияние внутреннего, скрытого полиморфизма водородного связывания оснований в Уотсон-Криковских парах, который обуславливает исходное неравноправное участие (А/Т)n и (G/C)n нуклеотидных последовательностей в формировании структурно-функциональных свойств геномной ДНК эукариот. Выявлена дифференциация 23 хромосом человека на 5 разных типов. Каждый тип характеризуется своим GC-составом экзонных областей белок-кодирующих генов и обладает отличительными особенностями в предрасположенности хромосом к спонтанных структурным точечным мутациям. Полученное разбиение хромосом на группы со спецификой нуклеотидного строения экзонов оказалось в корреляции с наблюдаемым распределением профилей экспрессии генов по всем 23 хромосомам человека.
Материалы доклада |
