|
Архив публикацийТезисыXXIV-ая конференцияДинамика открытых состояний молекулы ДНК под влиянием внешних периодических воздействийБашкирский государственный университет Институт биофизики клетки 1 стр. (принято к публикации)Постоянный рост количества различных устройств в технологической и бытовой сферах жизнедеятельности человека делает актуальным вопроса о влиянии постоянных и переменных физических полей на живые организмы. В нашей работе рассматривается задача, связанная с этим направлением: мы исследуем влияние постоянного и переменного полей на движение «открытого состояния» молекулы ДНК. Молекулу ДНК можно рассматривать как многокомпонентную физическую си-стему, состоящую из большого числа определенным образом расположенных в про-странстве атомных групп, образующих двойную спираль, и связанных друг с другом разнообразными сильными и слабыми связями. Такая система не статична и обладает внутренней подвижностью, обусловленной воздействием температуры, столкновением с молекулами раствора, взаимодействием с белками и т.д. В нашей работе мы рассматривали модель, эффективным образом учитывающую неоднородность по основаниям. В модели считается, что только угловые колебания оснований вокруг сахаро-фосфатных цепочек вносят вклад в раскрытие пар оснований и расплетание двойной спирали, т.е. в процесс образования «открытого состояния». Для математического описания вращательной динамики ДНК часто используют простую модель Инглэндера, основанную на уравнении синус-Гордона. Одно из его решений в виде кинка является математическим образом открытого состояния молеку-лы ДНК. Используя аналитические методы и методы компьютерного моделирования, нами были получены и проанализированы данные о поведении основных характеристик движения «открытых состояний» для плазмиды pTTQ18. Найдены временные зависи-мости скорости, координаты, размера и энергии кинка при разных значениях парамет-ров внешнего торсионного момента. Показано, что изменяя эти параметры, включая и выключая внешнее воздействие, можно регулировать скорость и направление движения кинка. |