English
!

Архив публикаций

Тезисы

XXIII-ая конференция

Транскриптомные модели лабораторных животных для анализа генов, связанных с агрессивным поведением

Бабенко В.Н., Спицина А.М., Дергилев А.И., Кулакова Е.В., Орлов Ю.Л.

ИЦиГ СО РАН, Россия, 630090, Новосибирск, пр-т ак. Лаврентьева, 10, +7(383)3331278, bob@bionet.nsc.ru Новосибирский госуниверситет, Россия, 630090, Новосибирск, ул. Пирогова, 2, тел.+7(383)3634333, anastasia.spitsina@gmail.com Новосибирский госуниверситет, Россия, 630090, Новосибирск, ул. Пирогова, 2, тел.+7(383)3634333, arturd1993@yandex.ru Новосибирский госуниверситет, Россия, 630090, Новосибирск, ул. Пирогова, 2, тел.+7(383)3634333, kylakovaekaterina@gmail.com ИЦиГ СО РАН, Россия, 630090, Новосибирск, пр-т ак. Лаврентьева, 10, +7(383)3331278, orlov@bionet.nsc.ru

1  стр. (принято к публикации)

Фундаментальная научная проблема системной биологии – изучение молекулярно-биологических и генетических основ агрессивного поведения. Рассмотрены молекулярно-генетические механизмы повышенной агрессивности с использованием уникальных разработанных в ИЦиГ СО РАН экспериментальных моделей животных с наследственно обусловленным и приобретенным агрессивным поведением. В Институте цитологии и генетики СО РАН благодаря целенаправленной многолетней селекции, начатой в 1980-х гг., были получены две популяции серых крыс резко различающихся по уровню агрессивности. В агрессивной популяции селекция на усиление агрессивного поведения проводилась с помощью теста на перчатку. (Рука экспериментатора в перчатке помещается в клетку с крысой; реакция крысы оценивается по балльной шкале).

Учитывая полигенность системы детерминации агрессивного поведения, в качестве основного подхода был избран метод полногеномного анализа транскриптома (RNA-seq) трех отделов мозга крысы - гипоталамус (Hypothalamus), покрышка среднего мозга (Tegmentum mesencephali), серое вещество (Substantia grisea centralis). Объем библиотек секвенирования для каждой реплики был порядка 20 млн ридов. На данной модели рассмотрены различия в процессах альтернативного сплайсинга, как одного из важнейших механизмов регуляции транскриптома. В результате идентификации случаев альтернативного сплайсинга с помощью программы MATS были выявлены достоверные (P



© 2004 Дизайн Лицея Информационных технологий №1533