Русский
!

Conference publications

Abstracts

XXIII conference

Transcriptome models on laboratory animals for analysis of genes related to aggressive behavior

Babenko V.N., Spitsina A.M., Dergilev A.I., Kulakova E.V., Orlov Y.L.

Institute of Cytology and Genetics SB RAS, Russia, 630090, Novosibirsk, Lavrentieva, 10, +7(383)3331278, bob@bionet.nsc.ru Novosibirsk State University, Russia, 630090, Novosibirsk, Prirogova, 2, +7(383)3331278, anastasia.spitsina@gmail.com Novosibirsk State University, Russia, 630090, Novosibirsk, Prirogova, 2, +7(383)3331278, arturd1993@yandex.ru Novosibirsk State University, Russia, 630090, Novosibirsk, Prirogova, 2, +7(383)3331278, kylakovaekaterina@gmail.com Institute of Cytology and Genetics SB RAS, Russia, 630090, Novosibirsk, Lavrentieva, 10, orlov@bionet.nsc.ru

1 pp. (accepted)

Фундаментальная научная проблема системной биологии – изучение молекулярно-биологических и генетических основ агрессивного поведения. Рассмотрены молекулярно-генетические механизмы повышенной агрессивности с использованием уникальных разработанных в ИЦиГ СО РАН экспериментальных моделей животных с наследственно обусловленным и приобретенным агрессивным поведением. В Институте цитологии и генетики СО РАН благодаря целенаправленной многолетней селекции, начатой в 1980-х гг., были получены две популяции серых крыс резко различающихся по уровню агрессивности. В агрессивной популяции селекция на усиление агрессивного поведения проводилась с помощью теста на перчатку. (Рука экспериментатора в перчатке помещается в клетку с крысой; реакция крысы оценивается по балльной шкале).

Учитывая полигенность системы детерминации агрессивного поведения, в качестве основного подхода был избран метод полногеномного анализа транскриптома (RNA-seq) трех отделов мозга крысы - гипоталамус (Hypothalamus), покрышка среднего мозга (Tegmentum mesencephali), серое вещество (Substantia grisea centralis). Объем библиотек секвенирования для каждой реплики был порядка 20 млн ридов. На данной модели рассмотрены различия в процессах альтернативного сплайсинга, как одного из важнейших механизмов регуляции транскриптома. В результате идентификации случаев альтернативного сплайсинга с помощью программы MATS были выявлены достоверные (P



© 2004 Designed by Lyceum of Informational Technologies №1533