|
|
S3. Анализ сложных биологических систем. Эксперимент и модели
Симпозиум с международным участием «Биофизика сложных систем.
Вычислительная и системная биология. Молекулярное моделирование»
Программа заседаний
25 января, вторник, 14.00–18.45
W4. Моделирование, визуализация и анализ данных в исследовании когнитивных систем Руководители: Браже Алексей Рудольфович, Постнов Дмитрий Энгелевич 15:05–15:10 перерыв
26 января, среда, 9.00–11.00
W1. Вычислительная и системная биология. Экологическое моделирование Руководители: Плюснина Татьяна Юрьевна, Белотелов Николай Вадимович, Полежаев Андрей Александрович - 9:00–9:30 Крупянский Юрий Федорович (Москва, ИНСТИТУТ ХИМИЧЕСКОЙ ФИЗИКИ ИМ. Н.Н.СЕМЕНОВА РАН, Отдел строения вещества) Архитектура конденсированной ДНК в бактериях (приглашенный доклад)
- 9:30–10:00 Комаров Владислав Михайлович (ПУЩИНО, ИНСТИТУТ БИОФИЗИКИ КЛЕТКИ РАН ФИЦ ПНЦБИ РАН, Лаборатория структуры и динамики биомолекулярных систем) К систематике хромосом человека (приглашенный доклад)
- 10:00–10:15 Беляева Наталья Евгеньевна (Москва, МОСКОВСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ УНИВЕРСИТЕТ ИМ. М.В.ЛОМОНОСОВА, Биологический ф-т, каф. биофизики) Роль цитохромного комплекса b6f в стабилизации процессов электроно-транспортной цепи при моделировании индукционных кривых флуоресценции микроводоросли Scenedesmus
- 10:15:10:30 Червицов Роман Николаевич (Москва, МОСКОВСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ УНИВЕРСИТЕТ ИМ. М.В.ЛОМОНОСОВА, Биологический ф-т, каф. биофизики) Определение токсического действия тяжёлых металлов на фитопланктон с помощью классификатора «Cлучайный лес»
- 10:30–10:45 Борисов Максим Сергеевич (Государственный университет «Дубна», Объединенный институт ядерных исследований) Прогнозирование загрязнения воздуха тяжелыми металлами используя данные космоснимков и машинное обучение
- 10:45:10:50 Кононов Виталий Алексеевич (Москва, РОССИЙСКИЙ УНИВЕРСИТЕТ ДРУЖБЫ НАРОДОВ, Аграрно-Технологический Институт) Применение методов машинного обучения для исследования устойчивости растений к стрессу и патогенам
- 10:50–10:55 Богданова Елизавета Александровна (Москва, Московский Государственный Университет имени М.В. Ломоносова, биологический ф-т, каф. биоинженерии) Аугментация данных для обучения основанного на искусственной нейронной сети классификатора последовательностей микробных родопсинов
26 января, среда, 15.00–18.00
W2. Молекулярное моделирование Руководители: Коваленко Илья Борисович, Хренова Мария Григорьевна, Шайтан Алексей Константинович 15.00–17.40 Устные доклады - 15.00–15.20 Душанов Эрмухаммад (Дубна, ОБЪЕДИНЕННЫЙ ИНСТИТУТ ЯДЕРНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ, Лаборатория радиационной биологии) Влияние амилоид бета пептида на свойства липидной системы с холестерином и мелатонином
- 15.20–15.40 Тычинин Дмитрий Игоревич (Москва, МОСКОВСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ УНИВЕРСИТЕТ ИМ. М.В.ЛОМОНОСОВА, Биологический ф-т, Кафедра биоинженерии) Предиктивная модель по оценке аффинности белковых и пептид-белковых комплексов в широком диапазоне констант взаимодействий
- 15.40–16.00 Кривицкая Александра Вячеславовна (Москва, Федеральный исследовательский центр "Фундаментальные основы биотехнологии" Российской академии наук, Институт Биохимии им А.Н. Баха) Механизмы реакции гидролиза имипенема карбапенемазами L1 и NDM-1
- 16.00–16.20 Ивонцин Леонид Андреевич (Москва, НИИ ЦИТОХИМИИ И МОЛЕКУЛЯРНОЙ ФАРМАКОЛОГИИ, СЕКТОР МАТЕМАТИЧЕСКОГО МОДЕЛИРОВАНИЯ И СТАТИСТИЧЕСКОЙ ОБРАБОТКИ РЕЗУЛЬТАТОВ) Молекулярно-динамическое моделирование протонных полуканалов FoF1-АТФ синтазы
- 16.20–16.40 Хренова Мария Григорьевна (Москва, МГУ им М.В. Ломоносова, Химический факультет ) Механизмы активации субстратов в активных центрах ферментов
- 16.40–17.00 Никитина Анна Олеговна (Казань, Казанский (Приволжский) федеральный университет, Институт физики) Молекулярное моделирование структуры олигомеров пептида PAP248-286
- 17.00–17.20 Федоров Владимир Андреевич (Москва, МОСКОВСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ УНИВЕРСИТЕТ ИМ. М.В.ЛОМОНОСОВА, Биологический ф-т, каф. биофизики) Изучение механизмов взаимодействия белков пластоцианина и цитохрома с6 с цитохромом f в цианобактериях и зеленых водорослях
- 17.20–17.40 Филин Павел Дмитриевич (Саратов, Саратовский государственный технический университет, Кафедра информационная безопасность автоматизированных систем) Исследование методами молекулярной динамики процесса образования наночастиц сульфида цинка в присутствии белка флагеллина
17.40–18.00 Стендовые доклады - Грибкова Анна (Москва, МОСКОВСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ УНИВЕРСИТЕТ ИМ. М.В.ЛОМОНОСОВА, Биологический ф-т, каф. биоинженерии) Построение классификатора для выявления белков, разделяющих жидкие фазы, методами машинного обучения
- Князева Анастасия Сергеевна (Москва, МГУ им. М.В. Ломоносова, Биологический факультет, Кафедра биоинженерии) Исследование скольжения ДНК в нуклеосоме методом молекулярного моделирования
- Жулидин Павел Андреевич (Саратов, Саратовский государственный технический университет, Кафедра "Информационная безопасность автоматизированных систем" Математическое моделирование и комплексы программ.) Исследование молекулярной динамики белковых структур на примере цитокина Tumor necrosis factor
- Захаров Александр Алексеевич (Саратов, Саратовский государственный технический университет) Молекулярное моделирование и анализ структур конформеров с целью исследования конформационного полиморфизма янтарной кислоты
27 января, четверг, 9.00–11.00
W2. Молекулярное моделирование Руководители: Коваленко Илья Борисович, Хренова Мария Григорьевна, Шайтан Алексей Константинович 9.00–10.40 Устные доклады - 9.00–9.20 Рубанов Артём Викторович (Тула, ТУЛЬСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ УНИВЕРСИТЕТ) Исследование денатурации ДНКна основе модели Пейрарда-Бишопа-Доксуа методом молекулярной динамики
- 9.20–9.40 Кулакова Анна Михайловна (Москва, Московский государственный университет имени М.В. Ломоносова, Химический факультет, кафедра физической химии) Гидролиз фосфорорганических соединений в активном центре фосфотриэстеразы из Pseudomonas diminuta
- 9.40–10.00 Аксенова Светлана (Дубна, ОИЯИ) Влияние модуляторов, мутаций и изменения состава субъединиц на активацию рецепторов NMDA
- 10.00–10.20 Левина Елена Олеговна (Долгопрудный, МОСКОВСКИЙ ФИЗИКО-ТЕХНИЧЕСКИЙ ИНСТИТУТ (ГОСУДАРСТВЕННЫЙ УНИВЕРСИТЕТ)) Влияние электронной делокализации на кето-енольную таутомерию
- Абатурова Анна Михайловна (Москва, МОСКОВСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ УНИВЕРСИТЕТ ИМ. М.В.ЛОМОНОСОВА, Биологический ф-т, каф. биофизики, Сектор информатики и биофизики сложных систем) Роль электростатических взаимодействий и начального положения молекулы цитохрома С в модели броуновской динамики образования предварительного комплекса с III дыхательным комплексом в кристе митохондрии
10.40–11.00 Стендовые доклады
27 января, четверг, 14.00–16.45
W3. Медицинская и радиационная биофизика Руководители: Плюснина Татьяна Юрьевна, Балабин Фёдор Алексеевич - 14:00–14:30 Нечипуренко Юрий Дмитриевич (Москва, ИНСТИТУТ МОЛЕКУЛЯРНОЙ БИОЛОГИИ ИМ. В.А.ЭНГЕЛЬГАРДТА РАН, Лаборатория ДНК-белковых взаимодействий) Повреждающие факторы при развитии COVID-19: механизмы и гипотезы (приглашенный доклад)
- 14:30–14:45 Киселевская-Бабинина Виктория Ярославовна (Москва, МГУ им. М.В. Ломоносова, Факультет вычислительной математики и кибернетики) Анализ данных и выбор терапии при COVID-19: модель Маркова
- 14:45–15:00 Вишняков Алексей (Киров (обл), ФГБОУ ВО Кировская государственная медицинская академия Минздрава РФ) Моделирование эпидемической обстановки COVID-19 по Кировской области
- 15:00–15:15 Кулеш Виктория Сергеевна (Москва, Первый МГМУ им. И.М.Сеченова, Центр математического моделирования в разработке лекарств) Системно-фармакологическое моделирование динамики ВИЧ-1 инфекции: систематический обзор литературы и составление схемы математической модели
- 15:15:15:30 Балабин Федор Алексеевич (Москва, Центр теоретических проблем физико-химической фармакологии РАН) Стохастическое интегрирование минимальной модели активации тромбоцита
- 15:30:15:45 Кусова Александра Михайловна (Казань, Казанский институт биохимии и биофизики Казанского научного центра Российской академии наук ) Влияние параметров внешних условий на белок-белковые взаимодействия фибриногена по данным трансляционной диффузии
- 15:45:16:00 Глебов Артем Александрович (Дубна, ОИЯИ, Лаборатория Радиационной Биологии, сектор математического моделирования радиационно-индуцированных эффектов) Моделирование нарушения нейрогенеза у взрослых после облучения частицами 56FE
- 16:00–16:15 Kolodkin Alexey (Amsterdam, ISBE.NL (the Infrastructure for Systems Biology Europe at the Netherlands)) Silicon Human: oxidative stress model for aging, Parkinson's disease and precision therapies
|
