Тематический семинар
Молекулярное моделирование 

Исследования с применением методов квантовой химии, молекулярной и броуновской динамики играют важную роль в изучении самых разных объектов. В рамках семинара предполагается обсуждение физических основ молекулярного моделирования и его применения в различных областях науки и техники.

26 января 2016, вторник, 11:00 - 13:30

Устные доклады

• Душанов Э. Изучение структуры инозин трифосфат пирофосфогидролизы человека hITPA
• Галочкина Т. В. Моделирование конформационной подвижности О-антигена липополисахарида грам-отрицательных бактерий
• Зленко Д. В. Формирование зародыша анизометрической фазы
• Пыркова Д. В. Роль фосфатидилхолина и фосфатидилсерина в формировании свойств двухкомпонентных мембран
• Рамазанов Р. Р. Люминесцирующие кластеры серебра, стабилизированные олигомером (5’-CCTCCTTCCTCC-3’) ДНК: исследование структуры с помощью КХ/MM метода
• Дьяконова А. Н. Многочастичное броуновское моделирование взаимодействия ферердоксина, ФНР и гидрогеназы Chlamydomonas reinhardtii

27 января 2016, среда, 16.00 - 19.00

• Головин А. В. Robotic mechanism-based QM/MM maturation of a scavenger antibody mutationally boosts its performance
• Холмуродов Х. Т. Молекулярная Динамика бионаноструктур в сочетание с экспериментами по нейтронному рассеянию
• Khusenov M. A. On Correlation Effect of the Van-der-Waals and Intramolecular Forces for the Nucleotide Chain - Metallic Nanoparticles - Carbon Nanotube Binding
• Жмуров А. А. Изучение наномеханики супервторичных структур методами молекулярного моделирования
• Гудимчук Н. Б. Молекулярно-механическая модель динамической микротрубочки
• Хренова М. Г. Механизм реакции гидролиза гуанозинтрифосфата в белковом комплексе Arl3-RP2 по результатам молекулярного моделирования
• Коваленко И. Б. Электростатические взаимодействия электронтранспортных белков в процессе диффузионного сближения
• Нестеренко А. М. КМ- и КМ/МД- расчет люминесценции Cu,Au-содержащих лиганд-стабилизированных комплексов в свободном состоянии и в кристалле
• Щербаков К. А. Квантово-химический конформационный и термодинамический анализ структур 20 протеиногенных L-аминокислот и их кремниевых аналогов
• Зубова Е. А. Coarse-grained DNA model able to reproduce ribose flexibility