Conference publications

Abstracts

XXVI conference

Molecular Modeling

Contents : Authors

• Армеев Г.А., Шайтан К.В., Шайтан А.К. Создание молекулярных моделей нуклеосом и их комплексов по разнородным экспериментальным данным (2019) 1 pp. (accepted)
• Шайтан К.В. Динамика фолдинга: загадки и отгадки (2019) (accepted)
• Васюченко Е.П., Федоров В.А., Абатурова А.М., Устинин Д.М., Коваленко И.Б. Молекулярное моделирование цитохромного bc1 комплекса с цитохромом с (2019) 1 pp. (accepted)
• Древаль В.Д., Федоров В.А., Холина Е.Г., Коваленко И.Б., Гудимчук Н.Б. Сравнение конформационной подвижности ГТФ- и ГДФ-связанного тубулина с использованием метода молекулярной динамики (2019) 1 pp. (accepted)
• Левина Е.О., Венер М.В. Гидратация карбоксильной группы диклофенака натрия (2019) 1 pp. (accepted)
• Федоров В.А., Хрущев С.С., Устинин Д.М., Коваленко И.Б., Ризниченко Г.Ю., Рубин А.Б. Образование электрон-транспортного белок-белкового комплекса пластоцианина и цитохрома f высших растений, зеленой водоросли и цианобактерий (2019) 1 pp. (accepted)
• Романова Е.Ю., Уварова Л.А. Марковская модель активного центра ферментативных систем (2019) 1 pp. (accepted)
• Станишнева-Коновалова Т.Б., Чемерис А.С., Бегрова Д.И., Соколова О.С. Роль белка Hof1 в регуляции сборки актиновых филаментов (2019) 1 pp. (accepted)
• Попинако А. Структурно-динамические особенности экстремофильной короткоцепочечной дегидрогеназы TsAdh319 из археи Thermococcus sibiricus в различных температурных режимах (2019) 1 pp. (accepted)
• Холина Е.Г., Орехов Ф.С., Коваленко И.Б., Боздаганян М.Е., Страховская М.Г. Создание крупно-зернистых липополисахаридных мембран P. aeruginosa с различными антигенными цепями (2019) 1 pp. (accepted)
• Князева А.С., Армеев Г.А., Шайтан А.К., Шайтан К.В. Оценка изменения свободной энергии депротонирования аминокислот, участвующих в переносе протона, в ходе фотоцикла бактериородопсина (2019) 1 pp. (accepted)
• Хренова М.Г., Цирельсон В.Г. На пути к предсказательной теоретической биохимии: квантово-топологический анализ взаимодействий в реакционных интермедиатах и фоторецепторных системах (2019) 1 pp. (accepted)
• Терехова Е.О, Егорова А.Н., Сташ А.И, Цирельсон В.Г. Гомотропические и гетеротропические силы в кристалле KNbO3, восстановленные из данных прецизионного рентгенодифракционоого эксперимента (2019) 1 pp. (accepted)
• Буслаев П.И., Мустафин Х.С., Гущин И.Ю. Анализ конформаций молекул липидов при помощи метода главных компонент (2019) 1 pp. (accepted)
• Краснобаева Л.А., Якушевич Л.В. О статистике ансамбля из N одинаковых кинков ДНК (2019) 1 pp. (accepted)
• Томилко А.В., Хренова М.Г., Цирельсон В.Г. Стерические особенности взаимодействия антибиотиков цефалоспоринового ряда с металло-β-лактамазой (2019) 1 pp. (accepted)
• Лихачев И.В., Кондратьев М.С. The mechanical properties of lipase mutants research by the method of molecular dynamics (2019) 1 pp. (accepted)
• Абатурова А.М., Коваленко И.Б., Федоров В.А., Рубин А.Б. Brownian dynamics simulation of complex formation of animal and yeast proteins cytochrome c with cytochrome c1 (2019) 1 pp. (accepted)
• Хомич Д.А., Нестеренко А.М, Волков Ю.А., Асадчиков В.Е., Тихонов А.М., Ермаков Ю.А. Structural parameters of lipid monolayers from DMPS during phase transitions studied by molecular dynamics and X-ray reflectometry (2019) 1 pp. (accepted)
• Тимохина Е.Н., Демин В.А., Чернозатонский Л.А., Неделина О.С. Ab initio изучение влияния воды на возможность диссоциативного захвата электрона в растворе ортофосфорной кислоты (2019) 1 pp. (accepted)
• Новицкая О.С., Буслаев П.И., Гущин И.Ю. Моделирование белок-липидного комплекса ротора АТФ-синтазы (2019) 1 pp. (accepted)
• Коц Е.Д., Хренова М.Г. Роль электронной плотности в описании реакционных интермедиатов ферментативных процессов (2019) 1 pp. (accepted)
• Лопанская Ю.Н., Холина Е.Г., Федоров В.А., Коваленко И.Б., Гудимчук Н.Б. анализ взаимодействия кинетохорного комплекса NDC80 и микротрубочки методом молекулярно-динамических расчетов (2019) 1 pp. (accepted)
• Bozdaganyan M.E., Orekhov P.S. Interaction Of Hyaluronic Acid With Dermal Membrane: A Molecular Dynamics Simulation Study (2019) 1 pp. (accepted)
• Verigin V.S., Syrbu E.N., Likhachev I.V., Balabaev N.K. Molecular dynamics trajectories visualization website (2019) 1 pp. (accepted)
• Anashkina A.A., Uroshlev L.A., Torshin I.Y., Esipova N.G., Tumanyan V.G. Characteristics and Role of Conformationally Predetermined Segments of aPpolypeptide Chain in Proteins (2019) 1 pp. (accepted)
• Andreeva E.A., Armeev G.A., Shaytan A.K. GROMACS force field parameters and molecule topology editing (2019) 1 pp. (accepted)
• Chemeris A.S., Sokolova O.S., Gautreau A. Tankyrase regulates actin polymerization via Arp2/3 complex’ inhibitor arpin (2019) 1 pp. (accepted)
• Diakonova A.N., Fyodorov V.A., Khruschev S.S., Kovalenko I.B., Riznichenko G.Yu. Modeling of interactions between ferredoxin and ferredoxin-NADP-reductase from different phosynthetic organisms (2019) 1 pp. (accepted)
• Kasumov E.A., Kasumov R.E., Kasumova I.V. Theoretical calculations of the energy balance of ATP synthase gamma-subunit rotation (2019) 1 pp. (accepted)
• Komarov V.M., Samchenko A.A., Kondratiev M.S. On the role of G/C tracks in the structural organization of the human genome (2019) 1 pp. (accepted)
• Kondratyev M.S., Zakharova E.V. Computer screening for reducing ligands for human peroxiredoxin 6 (2019) 1 pp. (accepted)
• Kondratyev M.S., Samchenko A.A., Komarov V.M. Docking steroids on insect ecdysone receptor (2019) 1 pp. (accepted)
• Kots E.D., Kulakova A.M., Brekhov A.T. Application of Markov state model to discovery of potential allosteric sites on the surface of RAS protein (2019) 1 pp. (accepted)
• Kovalenko I.B., Orekhov P.S., Zhmurov A.A., Fedorov V.A., Kholina E.G., Gudimchuk N.B. A coarse-grained model of tubulin protein based on molecular dynamics trajectories (2019) 1 pp. (accepted)
• Krivitskaya A.V., Khrenova M.G., Tsirelson V.G. Electron density features and key interactions of hydrolysis cephalosporins by metallo-β-lactamase (2019) 1 pp. (accepted)
• Kulakova A., Khrenova M., Nemukhin A. Molecular modeling of mechanism of interaction between KRASG12C protein and compounds ARS-853 and ARS-1620 (2019) 1 pp. (accepted)
• Kulakova A., Alanya E., Babchuk I, Kots E. Molecular modeling of conformational transition in RAS·GAP complex (2019) 1 pp. (accepted)
• Kuznetsov A.S., Efremov R.G. Dimerization of protein transmembrane domains: the role of lipid environment (2019) 1 pp. (accepted)
• Meteleshko Y.I., Nemukhin A.V., Khrenova M.G. Molecular modeling of mutant forms of iLOV protein with derivatives of flavin as chromophores (2019) 1 pp. (accepted)
• Molotkovsky R.J., Galimzyanov T.R., Batischev O.V. Lipid composition of the membrane and the depth of embedding of the fusion peptide are regulators of membrane fusion (2019) 1 pp. (accepted)
• Nikonov E.G., Popovičová M. Molecular dynamic simulation of wet water vapor transportation processes in a porous medium (2019) 1 pp. (accepted)
• Orlov M.A., Kondratiev M.S., DzelyadinT.R., Sorokin A.A. T7 RNA Polymerase Interactions With a Promoter: Role of DNA Physicochemical Properties (2019) 1 pp. (accepted)
• Pospelova I., Armeev G.A., Shaytan A.K. Molecular modeling of H3-H4 histone dimers and analysis of their plasticity (2019) 1 pp. (accepted)
• Sakibaev F.A., Pankova S.M., Koroleva V.A., Ermolaeva V.V., Borodina A.S., Holyavka M.G., Artyuhov V.G. In silico search for charged and hydrophobic amino acid residues on the surface of ficin, bromelain and papain molecules (2019) 1 pp. (accepted)
• Tereshkin E.V., Loiko N.G., Tereshkina K.B., Kovalenko V.V., Zuykova A.A., Popelkovskaya A.I., Krupyanskii Y.F. Location of DNA in complexes with DNA stabilizing proteins DPS and SASP (2019) 1 pp. (accepted)
• Yakushevich L.V. Is it possible to create electronic analogue of the DNA molecule? (2019) 1 pp. (accepted)
• Zakir'yanov F.K., Mel'nikov V.Yu. Simulation of the charge transfer process in the DNA molecule (2019) 1 pp. (accepted)

Search