|
S3 Анализ сложных биологических систем. Эксперимент и модели
Программа заседаний
28 января, вторник, 16:00–19:00
Институт биофизики клетки РАН, Пущино, Круглый зал Института биофизики клетки РАН – над Малым залом, 2 этаж
Руководители: Татьяна Юрьевна Плюснина, Андрей Александрович Полежаев, Николай Вадимович Белотелов
Приглашённые доклады W1+W3
- 16.00 – 16.30 Логофет Дмитрий Олегович (Москва, Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт физики атмосферы им. А.М. Обухова Российской академии наук, Лаборатория математической экологии) Применение искусственного интеллекта в экологическом моделировании: от Мак-Каллока – Питтса до Kandinsky 3.1
- 16.30 – 17.00 Ермаков Александр Сергеевич (Московский государственный университет им. М.В.Ломоносова, Биологический факультет, кафедра Эмбриологии) Механика живого и функционирование кровеносных сосудов
- 17.00 – 17.30 Нарциссов Ярослав Рюрикович (Москва, НИИ Цитохимии и молекулярной фармакологии, Сектор математического моделирования и статистической обработки результатов) Моделирование формирования градиента концентрации оксида азота в стенке артерий с учетом ее гетерогенности и влияния гемодинамики течения крови в сосуде
- 17.30 – 18.00 Сысоев Илья Вячеславович (Санкт-Петербург, Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования «Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого», кафедра высшей математики института физики и математики) Реконструкция модели нейроподобного генератора по экспериментальным сигналам (Сысоев И.В., Большаков Д.И., Мищенко М.А., Матросов В.В.)
Устные доклады W1+W3
- 18.00 – 18.15 Машковцева Елена Валерьевна (Москва, НИИ Цитохимии и молекулярной фармакологии) Оценка эмоционального и когнитивного статуса у пациентов с астенией (Машковцева Е.В., Шишкова В.Н., Нарциссов Я.Р.)
- 18.15 – 18.30 Чистякова Юлия Алексеевна (Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова, Биологический факультет) Исследование влияния профиля инсулина на накопление триглицеридов в адипоците с помощью математической модели (Чистякова Ю.А., Фурсова П.В., Хрущев С.С., Плюснина Т.Ю.)
- 18.30 – 18.40 Этезова Фарида Муссаевна (Москва, Нии цитохимии и молекулярной фармакологии, Сектор математического моделирования и статистической обработки результатов) Применение методов 3D моделирования для изучения пространственно-временного распределения парацетамола (Этезова Ф.М., Нарциссов Я.Р., Машковцева Е.В.)
- 18.40 – 18.45 Дегтярева Ольга Васильевна (Пущино, Федеральное государственное бюджетное учреждение науки "Федеральный исследовательский центр "Пущинский научный центр биологических исследований Российской академии наук", Институт Биофизики Клетки РАН) Новое в люминесценции аминокислот и белков (Дегтярева О.В., Терпугов Е.Л.)
29 января, среда, 15:00–19:00
Дистанционно с возможностью очного участия: Биологический факультет Московского государственного университета им. М.В.Ломоносова, каф. биофизики, ауд. Новая
Руководители: Илья Борисович Коваленко, Мария Григорьевна Хренова, Алексей Константинович Шайтан
Устные доклады W2
- 15.00 – 15.15 Кондратьев Максим Сергеевич (Пущино, Институт биофизики клетки РАН, Лаборатория структуры и динамики биомолекулярных систем) Квантово-химическое моделирование неканонических аминокислот (Бадалов А.А., Юртаева А.М., Комаров В.М., Кондратьев М.С.)
- 15.15 – 15.30 Ивонцин Леонид Андреевич (Москва, НИИ Цитохимии и молекулярной фармакологии, сектор математического моделирования и статистической обработки результатов) Структурные и функциональные характеристики протонных полуканалов бактериальной FoF1-АТФсинтазы (Ивонцин Л.А., Машковцева Е.В., Нарциссов Я.Р.)
- 15.30 – 15.45 Вольхин Илья Александрович (Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова, Факультет биоинженерии и биоинформатики) Исследование взаимодействия между пластоцианином и фотосистемой 1 гороха с использованием молекулярного моделирования (Вольхин И.А., Федоров В.А., Хрущев С.С., Коваленко И.Б.)
- 15.45 – 16.00 Федулова Анастасия Сергеевна (Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова, Биологический факультет, Кафедра биоинженерии ) Моделирование динамики внутренне-неупорядоченных хвостов гистонов в составе нуклеосом (Федулова А.С., Моторин Н.А., Шаряфетдинова А.С., Армеев Г.А., Шайтан А.К.)
- 16.00 – 16.15 Лихачев Илья Вячеславович (Пущино, Институт математических проблем биологии РАН, ЛМД) Использование четвертого измерения в расчетах молекулярной динамики для вставки растворителя в молекулу ДНК
- 16.15 – 16.30 Полуян Сергей Владимирович (Дубна, Университет "Дубна", кафедра РИВС ИСАУ) Применение метода выборки переходных поверхностей для численной оценки константы скорости ассоциации (Полуян С.В., Ершов Н.М.)
- 16.30 – 16.45 Кривицкая Александра Вячеславовна (Москва, ФИЦ Фундаментальные основы биотехнологии РАН, Институт Биохимии им А.Н. Баха) КМ/ММ подход в поиске новых ингибиторов (Кривицкая А.В.)
- 16.45 – 16.50 Кузнецов Михаил Евгеньевич (Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова, Химический факультет) Активация карбапенемов в активном центре OXA-48 (Кузнецов М.Е., Кривицкая А.В., Хренова М.Г.)
17.00 – 17.15 Кофе-брейк
- 17.15 – 17.30 Поляков Игорь Вадимович (Московский государственный университет им. М.В.Ломоносова, Химический факультет, кафедра физической химии) Молекулярное моделирование гидролиза гуанозитрифосфата белковым комплексом RAS-GAP (Поляков И.В., Хренова М.Г.)
- 17.30 – 17.45 Терёшкина Ксения Борисовна (Москва, ФГБУН ФИЦ Химической физики им. Н.Н. Семенова РАН, Отдел строения вещества) Компьютерное моделирования ДНК-стабилизирующего белка Dps бактерии Escherichia coli с ДНК разной длины (Терешкина К.Б., Терешкин Э.В., Крупянский Ю.Ф.)
- 17.45 – 18.00 Холина Екатерина Георгиевна (Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова, Биологический факультет) Изучение процесса транслокации биоцидов через наружные мембраны грамотрицательных бактерий (Холина Е.Г., Коваленко И.Б., Страховская М.Г.)
- 18.00 – 18.15 Абатурова Анна Михайловна (Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова, Биологический факультет, каф. биофизики, Сектор информатики и биофизики сложных систем) Влияние IV дыхательного комплекса на кинетику связывания цитохрома С и димера III дыхательного комплекса в модели броуновской динамики (Абатурова А.М., Ризниченко Г.Ю.)
- 18.15 – 18.30 Аксенова Светлана Валерьевна (Дубна, Объединённый институт ядерных исследований) Моделирование поведения глутаматных рецепторов гиппокампа при модификации липидной и белковой структур под действием окислительного стресса (Душанов Э.Б., Аксенова С.В., Батова А.С., Бугай А.Н.)
- 18.30 – 18.45 Метелешко Юлия Игоревна (Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова, Химический факультет) Молекулярное моделирование активации каталитического домена глутаминазы почечного типа человека (Метелешко Ю.И., Леонова М.С., Хренова М.Г.)
Краткие сообщения (стендовые доклады) W2 – 5 минут
- Мамаева Наида Юсуповна (Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова, Биологический факультет, кафедра Биоинженерии) Использование флуоресцентного анализа для оценки работы CRISPR/dCas9-систем: от in vitro экспериментов в бесклеточных системах до исследований в бактериальных и эукариотических клетках (Мамаева Н.Ю., Фескин П.Г., Разинкова А.И., Шайтан А.К.)
- Холманских Даниил Дмитриевич (Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова, Химический факультет) Механизм ингибирования пенициллин-связывающего белка 3 из Pseudomonas aeruginosa (2-нитробензамидо)метилборной кислотой (Холманских Д.Д., Кривицкая А.В.)
- Федоров Владимир Андреевич (Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова, Биологический факультет, каф. биофизики) Исследование изгибной деформации протофиламетов тубулина формирующих микротрубочки в эу- и про-кариотических клетках методом молекулярной динамики (Федоров В.А., Холина Е.Г., Гудимчук Н.Б., Коваленко И.Б.)
- Татарникова Дарья Андреевна (Московский государственный университет им. М.В.Ломоносова, Химический факультет) Молекулярное моделирование белков семейства GES (Татарникова Д.А., Кривицкая А.В.)
- Коробов Николай Андреевич (Москва, ФГБОУ ВПО МГТУ "СТАНКИН", кафедра "Прикладная математика") Метод геометрического различения изомеров молекулярных структур с использованием матриц расстояний (Назаренко К.М., Коробов Н.А., Марков П.Н., Назаренко Е.С., Посяева М.Г., Буевич Т.Л., Надыкто А.Б.)
30 января, четверг, 9:00–10:45
Дистанционно
Руководители: Татьяна Юрьевна Плюснина, Андрей Александрович Полежаев, Николай Вадимович Белотелов
Устные доклады W1+W3
- 9.00 – 9.15 Цхай Александр Андреевич (Барнаул, Институт водных и экологических проблем СО РАН, лаборатория гидрологии и геоинформатики, доктор технических наук, профессор) Модель экосистемы Телецкого озера: круговорот биогенных веществ и их ассимиляция (Цхай А.А., Романов М.А., Куприянов В.А.)
- 9.15 – 9.30 Тодоренко Дарья Алексеевна (Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова, Биологический факультет, каф. биофизики) Оценка фитотоксичности метилртути путем анализа различных индукционных кривых флуоресценции хлорофилла (Тодоренко Д.А., Маторин Д.Н.)
- 9.30 – 9.45 Червицов Роман Николаевич (Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова, Биологический факультет, каф. биофизики) Анализ состояния природного фитопланктона из реки Кальмиус методами машинного обучения (Червицов Р.Н, Чуфицкий С.В., Хрущев С.С., Плюснина Т.Ю.)
- 9.45 – 10.00 Васильева Мария Александровна (Дубна, Объединенный институт ядерных исследований, Лаборатория радиационной биологии) Применение экспериментальных методов изучения индукции повреждений ДНК к анализу математической модели репарации двунитевых разрывов (Васильева М.А., Бугай А.Н., Душанов Э.Б., Пархоменко А.Ю.)
- 10.00 – 10.15 Киселева Диана Геннадьевна (Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова, Биологический факультет, каф. биофизики, Сектор информатики и биофизики сложных систем) Оценка влияния отека миокарда на скорость проводимости и распределение щелевых соединений с помощью двумерной модели Фитцхью-Нагумо (Киселева Д.Г., Червицов Р.Н., Плюснина Т.Ю.)
- 10.15 – 10.30 Широносов Валентин Георгиевич (Ижевск, Научно-исследовательский центр "ИКАР") Проблемы и методы современной аэроионотерапии, и пути их решения (Широносов В.Г., Богатырев Р.А.)
- 10.30 – 10.35 Краснобаева Лариса Александровна (Томский государственный университет, Физический факультет, кафедра теоретической физики) О временной зависимости энергии и размера кинков плазмиды pPF1 (Краснобаева Л.А., Якушевич Л.В.)
- 10.35 – 10.40 Степанов Антон Викторович (Чебоксары, Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Чувашский государственный аграрный университет», кафедра математики, физики и информационных технологий) Установление факторов коморбидного течения заболеваний транзитного периода молочных коров (Симурзина Е.П., Степанов А.В., Попов А.П.)
- 10.40 – 10.45 Nasibova Aygun Namiq (Baku, Institute of Radiation Problems, National Academy of Sciences of Azerbaijan) Взаимодействие металлических наночастиц и растительных систем (Халилов Р.И., Насибова А.Н.) (доклад не был представлен)
30 января, четверг, 14:00–15:45
Дистанционно с возможностью очного участия: Биологический факультет Московского государственного университета им. М.В.Ломоносова, каф. биофизики, ауд. Новая
Руководитель: Алексей Рудольфович Браже
Устные доклады W4
- 14.00 – 14.15 Загубная Ольга Анатольевна (Москва, НИИ Цитохимии и молекулярной фармакологии, Сектор математического моделирования и статистической обработки результатов ) Алгоритм создания фантома синаптического контакта и его применение для описания глутаматергической нейропередачи (Загубная О.А., Нарциссов Я.Р.)
- 14.15 – 14.30 Ткачев Анна (Москва, Сколтех) Новые классификаторы психиатрических заболеваний (Ткачев А.)
- 14.30 – 14.45 Ясюк Виталий Олегович (Саров) Влияние аутапсов на образование регулярных режимов колебаний в малых системах импульсно связанных тормозных интернейронов неокортекса (Ясюк В.О., Гостева И.В.)
- 14.45 – 15.00 Крючечникова Анна Николаевна (Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова, Биологический факультет) Моделирование и анализ астроцитарной морфологии на базе алгоритма колонизации пространства (Крючечникова А.Н., Левдик Т.Г., Браже А.Р.)
- 15.00 – 15.15 Лукин Павел Олегович (Курский государственный университет) Модель нейромедиаторного воздействия на нейроглиоваскулярную единицу (Лукин П.О., Лагоша С.В., Вервейко Д.В., Браже А.Р., Верисокин А.Ю.)
- 15.15 – 15.30 Лагоша Станислав Витальевич (Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова, Биологический факультет, кафедра биофизики) Математическое моделирование эффектов диффузии в aнсамбле нейроглиоваскулярных единиц (Лагоша С.В., Верисокин А.Ю., Вервейко Д.В., Браже А.Р.)
|