Conference publications

Abstracts

XXIV conference

Molecular Modeling

Contents : Authors

• Коваленко И.Б., Хренова М.Г. Современные методы молекулярного моделирования (2017) (accepted)
• Коц Е.Д., Хренова М.Г., Лущекина С.В., Григоренко Б.Л., Немухин А.В., Варфоломеев С.Д. Решение задач ферментативного катализа методами молекулярной динамики (2017) 1 pp. (accepted)
• Белега Е.Д. Фазы и фазовые переходы в малых кластерах молекул воды (2017) 1 pp. (accepted)
• Попова Е.В., Неелов И.М. Молекулярно-динамическое моделирование взаимодействия лизинового дендримера 2-го поколения и пептида Семакс (2017) 1 pp. (accepted)
• Березюк Н.С, Жмуров А.А. Изучение наномеханики β-спиральных структур методами молекулярного моделирования in silico (2017) 1 pp. (accepted)
• Гудимчук Н.Б., Орлова М.В., Федоров В.А., Коваленко И.Б. Исследование конформации ГТФ-тубулина и ее роли для полимеризации микротрубочки (2017) 1 pp. (accepted)
• Федосов М.Е.,Коробов Н.А.,Назаренко К.М. Оценка временных характеристик вычислительных экспериментов с использованием квантово-химических методов (2017) 1 pp. (accepted)
• Минин К.А., Кириллов И.В., Ягафарова К.М., Жмуров А.А. Крупнозернистая модель для описания биомолекулярных систем, содержащих ДНК и белок (2017) 1 pp. (accepted)
• Норман Г.Э. Атомистический многомасштабный взгляд на мир как мировоззрение и метод исследований (2017) (accepted)
• Боздаганян М.Е., Коваленко И.Б., Шайтан К.В. Computer simulation of lipid raft dynamics (2017) 1 pp. (accepted)
• Судаков Р.В., Зленко Д.В. Изучение фотоактивации белка ОСР методами молекулярной динамики (2017) 1 pp. (accepted)
• Шайтан К.В. Принцип минимальной скорости диссипации энергии в конформационной динамике биополимеров (2017) (accepted)
• Подпорин Д.А., Кондратьев М.С. Анализ пространственной структуры двух диоксигеназ - деструкторов нефти (2017) 1 pp. (accepted)
• Маленков А.П., Лихачев И.В. Технология создания трехмерных моделей белковых комплексов в образовательном процессе (2017) 1 pp. (accepted)
• Васильева Л.Ю., Уварова Л.А., Романова Е.Ю. Обсуждение квантово-химического подхода при моделировании активных центров ферментативных систем (2017) 1 pp. (accepted)
• Душанов Э.Б. Молекулярное моделирование отдельных этапов восстановления ЦПД-фотоповреждений ДНК (2017) 1 pp. (accepted)
• Холявка М.Г., Макин С.М., Кондратьев М.С., Артюхов В.Г. Надмолекулярная организация экзо- и эндоинулиназ: сравнительный аспект (2017) 1 pp. (accepted)
• Каспер Ю.В., Тучин А.В., Битюцкая Л.А. Электронная структура сжатого мультиграфена (2017) 1 pp. (accepted)
• Рожок И.Е, Жмуров А.А. Изучение равновесных и механических свойств фибринового геля методом компьютерного моделирования (2017) 1 pp. (accepted)
• Чугунов А.О., Ефремов Р.Г. От молекулярных поверхностей к картам: как «белковая топография» помогает раскрыть структурно-функциональные зависимости в белках и пептидах (2017) 1 pp. (accepted)
• Хомич Д.А., Нестеренко А.М., Ермаков Ю.А. Изучение механизмов адсорбции катионов Na+ на липидные мембраны на молекулярном уровне (2017) 1 pp. (accepted)
• Назаренко Е.С., Марков П.Н., Назаренко К.М., Надыкто А.Б. Термохимические характеристики ионов (NH₄⁺)(NH₃)(H₂O)_n и (NH₄⁺)(NH₃)(H₂SO₄)(H₂O)_n (2017) 1 pp. (accepted)
• Глушков Г.И., Тучин А.В. Моделирование спиновой поляризации одностенных углеродных нанотрубок (0,9) во внешнем электрическом поле (2017) 1 pp. (accepted)
• Назаренко К.М., Назаренко Е.С., Марков П.Н., Коробов Н.А. Эффективные средства автоматизации математического моделирования молекулярных и наносистем (2017) 1 pp. (accepted)
• Финкельштейн А.В. Два взгляда на проблему сворачивания белка (2017) (accepted)
• Трегубова М.А., Зленко Д.В., Стовбун С.В. (2017) 1 pp. (accepted)
• Лакхно В.Д. Электронные процессы в биополимерах. Нанобиоэлектроника (2017) (accepted)
• Федоров В.А., Хрущев С.С., Коваленко И.Б. Роль электростатических взаимодействий в формировани электрон-транспортного комплекса белков пластоцианина и цитохрома f цианобактерии P. laminosum (2017) 1 pp. (accepted)
• Васильева Л.Ю., Уварова Л.А., Романова Е.Ю. Теоретические методы, используемые при моделировании электронной структуры активных центров бионанокомплексов (2017) 1 pp. (accepted)
• Омарова А.Г., Зленко Д.В. Исследование свойств связанной воды над различными типами поверхностей методом молекулярной динамики (2017) 1 pp. (accepted)
• Рулев М.И., Соловьев Д.В., Иваньков А.И., Рижиков Ю.Л., Рогачев А.В., Ковалев Ю.С., Горделий В.И., Куклин А.И. Исследование бинарных смесей ДПФХ и ПОФХ методами измерения плотности и МУР вблизи точки фазового перехода (2017) 1 pp. (accepted)
• Холина Е.Г., Коваленко И.Б., Орехов Ф.С., Боздаганян М.Е., Страховская М.Г. Создание крупно-зернистой модели наружной мембраны клеточной стенки P.aeruginosa (2017) 1 pp. (accepted)
• Anashkina A.A., Kravatsky Y.V., Kuznetsov E.N., Adzhubei A.A. QASDOM: A Meta-Server for Scoring, Analysis and Ranking of Protein-Protein Docking Models (2017) 2 pp. (accepted)
• Dushanov E.B., Koltovaya N.A. Analysis of the P32T substitution effect to interaction between protomers of human inosine triphosphat pirophosphogidrolase hITPA (2017) 1 pp. (accepted)
• Grineva O.V. Glycine hydration in crystals and clusters (2017) 1 pp. (accepted)
• Hamidova D.N., Popova E.V., Ilyash M.Yu., Neelov I.M. Interaction of lysine dendrimers with fragments of amyloid peptides and fibrils. Molecular dynamics (2017) 1 pp. (accepted)
• Iaparov B.I., Okenov A.O., Moskvin A.S. Electron-conformational transformations explain both thermal regulation and activation of ion channels (2017) 1 pp. (accepted)
• Kasumov E.A., Belyaev I.N., Kasumov R.E., Kasumova I.V. Theorotical calculations of the energy balance of twisting ATP synthase b2 subunit (2017) 1 pp. (accepted)
• Khrenova M.G., Kots E.D., Nemukhin A.V. Molecular modeling of the photophysical properties of fluorescent proteins based on flavin (2017) 1 pp. (accepted)
• Klyuchnikov E.P., Zhmurov A.A. Using agent-based modeling in biological reaction-diffusion problems (2017) 1 pp. (accepted)
• Kutsova D.S., Bogatikov E.V., Shebanov A.N., Bormontov E.N. Impact of impulse heating parameters on desorption effectiveness in silicalite by molecular dynamic simulation (2017) 1 pp. (accepted)
• Milchevskyi Yu.V., Nikitin A.M., Lukshin S.A., Milchevskaya V.Yu., Tumanian V.G. Protein local structure prediction based on the physico-chemical properties of the sequence (2017) 2 pp. (accepted)
• Moiseenko D.Y., Zlenko D.V. Towards validating quaternary lipid membrane simulations (2017) 1 pp. (accepted)
• Moskvin A.S. Electron-conformational model for the ryanodine channels of the heart cell (2017) 1 pp. (accepted)
• Nesterenko A.M., Zlenko D.V., Galochkina T.V., Mamonov P.A. Automatic force field generation based on cheminformatic analysis of molecular structure (2017) 1 pp. (accepted)
• Orekhov P.S., Steinhoff H.-J., Engelhard M., Shaitan K.V. Reconstruction of the Transmembrane Photoreceptor Lattices of Archaebacteria by Means of Computational Modeling (2017) 1 pp. (accepted)
• Pyrkova D.V., Efremov R.G. Reproducibility of properties of two-component lipid membranes in different force fields (2017) 1 pp. (accepted)
• Ramazanov R.R., Vdovichev A.A., Sych T.S., Kononov A.I. Ag cluster luminophores at oligonucleotide matrix: are we ready for understanding of detailed structure? (2017) 1 pp. (accepted)
• Scherbakov K.A., Veselovsky A.V. Discovery of novel potential inhibitors of human androgen receptor (2017) 1 pp. (accepted)
• Shavykin O.V., Mikhailov I.V., Neelov I.M, Darinskii A.A. Investigation of structural characteristics of dendrimers with a large asymmetry of branching by brownian dynamics method (2017) 1 pp. (accepted)
• Sukovatyi L.A., Deeva A.A., Nemtseva E.V. Structural dynamics and related functions of enzymes belonging to the bacterial luciferase family (2017) 1 pp. (accepted)
• Tereshkina K.B., Sinitsyn D.O., Chulichkov A.L., Krupyanskii Y.F. Dynamics of the initial stage of dodecamers DNA-binding protein DPS crystallization (2017) 1 pp. (accepted)
• Vlasov A.V., Zinovev E.V., Suslov D.A., Gordeliy V.I. Small-angle X-ray data analysis of lipidic in-meso phases (2017) 1 pp. (accepted)
• Zhmurov A.A., Protopopova A.D., Litvinov R.I., Zhukov P.I., Mukhitov A.R., Zhmurova N.V., Weisel J.W., Barsegov V.A. Structural basis of fibrin polymerization (2017) 1 pp. (accepted)
• Zlenko D.V. Molecular Model of PBS and PSII Coupled Rows in Cyanobacteria (2017) 1 pp. (accepted)

Search