![]() ![]() |
Conference publicationsAbstractsXXIII conferenceМеханизм реакции гидролиза гуанозинтрифосфата в белковом комплексе Arl3-RP2 по результатам молекулярного моделированияХимический факультет МГУ имени М,В. Ломоносова, Москва, Ленинские Горы 1/3 1 pp. (accepted)В работе обсуждается механизм гидролиза гуанозинтрифосфата в белковом комплексе Arl3-RP2, полученный в рамках комбинированного метода квантовой механики / молекулярной механики. В процессе реакции ключевую роль играет аминокислотный остаток Gln71, участвующий в переносе протона от каталитической молекулы воды на фосфатную группу, отделяющуюся в процессе гидролиза; в ходе реакции функциональная группа переходит в таутомерную имидную форму. Активный сайт рассматриваемого белкового комплекса имеет много общего с другой ГТФазой Ras-GAP, однако, окружение ключевого остатка глютамина отличается значительно, что приводит к различиям в энергетических профилях реакции и структурах интермедиатов. Работы выполняются в рамках проекта РФФИ № 15-33-20579 мол_а_вед.
|