|
ДокладыСтатистическое оценивание показателей производительности конформационного поискаМосковский Государственный Технологический Университет «СТАНКИН» Россия, 127055, г. Москва, ул. Вадковский пер. 1, Тел.: (+7 499)972-95-00; e-mail: cmr.nazy@gmail.com Целью данной работы является получение количественной оценки производительности вычислительных Grid-систем и определение оптимальной стратегии утилизации процессорного времени при моделировании структуры и свойств молекулярных кластеров. Вычислительная сложность конформационного поиска [1] определяется временем обработки всех начальных конфигураций. При использовании Grid-систем момент завершения последнего задания зависит от равномерности балансировки, которая определяется точностью оценок вычислительной сложности экспериментов и текущей производительности задействованных ЭВМ. В результате исследования установлено, что: - вычислительная сложность каждого шага оптимизации геометрической конфигурации молекулярной структуры с использованием пакета Gaussian 09 практически одинакова, и время его выполнения может служить показателем производительности используемых ЭВМ; - число шагов оптимизации идентичных исходных данных существенно варьируется и не может являться точным критерием качества используемых начальных условий; - затраты вычислительного времени на обработку заданий конформационного поиска молекулярных кластеров атмосферного происхождения допускают лишь интервальное оценивание; - проведение масштабных вычислительных экспериментов конформационного поиска следует организовывать с использованием длинных очередей заданий, беспорядочно дублируя их для повышения надежности эксплуатации Grid-систем; - высокая производительность достигается за счет динамической балансировки путем отмены выполненных расчетов по показаниям мониторинга результатов. Работа выполнена при поддержке РНФ, грант № 18-11-00247-П от 21.04.21.
Литература. 1. Анализ технических условий проведения вычислительных экспериментов конформационного поиска. Коробов Н.А., Марков П.Н., Назаренко Е.С., Назаренко К.М., Надыкто А.Б. В книге: Моделирование нелинейных процессов и систем. Материалы пятой международной конференции. 2021. С. 215-217.
Материалы доклада |
