!	Если во время конференции Вы планируете проживать в общежитие Пущино (других вариантов проживания в Пущино практически не осталось), то для поселения необходимо заполнить анкету. Анкету нужно прислать на адрес оргкомитета mce@mce.su до 17 января.

Архив публикаций

Тезисы

XXVI-ая конференция

Расположение ДНК в комплексах с ДНК-стабилизирующими белками DPS и SASP

Терешкин Э.В., Лойко Н.Г.¹, Терешкина К.Б., Коваленко В.В., Зуйкова А.А.², Попелковская А.И.², Крупянский Ю.Ф.

ИХФ РАН, Россия, 119991, Москва, ул. Косыгина, д. 4, +7(495)9397300, ramm@mail.ru

¹ФИЦ Биотехнологии РАН, Россия, 119071, Москва, Ленинский проспект, д. 33, стр. 2

²РХТУ им. Д.И. Менделеева, Россия, 125047, Москва, Миусская пл., д. 9

1 стр. (принято к публикации)

В работе проведено сравнительное изучение структурных особенностей in vivo кристаллов бактериальных культур, содержащих кристаллы ДНК-стабилизирующих белков DPS и SASP и соответствующих молекулярных систем. Оба белка участвуют в процессе in vivo (био-) кристаллизации нуклеоида, происходящей непосредственно в живой клетке и направленной на сохранение её генетического материала при неблагоприятных условиях. Основной белок, участвующий в процессе биокристаллизации в бактериальной клетке – это белок DPS (DNA-Binding Protein from Starved Cells, ДНК-стабилизирующий белок [впервые выделенный] из голодающих клеток). В спорах бактерий, биокристаллизация нуклеоида происходит с помощью другого класса белков – малых кислоторастворимых белков SASP (Small Acid-Soluble Proteins).

Были изучены клетки бактерий Escherichia coli штамма K12. В них инициировалась выработка белка DPS, молекулы которого образовывали кристаллы с ДНК [3]. Также изучались споры бактерий Bacillus cereus, нуклеоид которых кристаллизуется с участием белка SASP. Проведено сравнение дифрактограмм и кривых рассеяния указанных систем; изучена динамика нанокристаллов белков с короткими палиндромными участками ДНК 5'- GGGGGGGGGGA-3'. Динамика комплексов изучалась классическим методом молекулярной динамики с помощью программного комплекса Gromacs 5.1 с использованием специально разработанных протоколов [4].

Определены особенности в структурных, динамических и энергетических характеристиках нанокристаллов белков DPS и SASP с ДНК.

Работа выполнена с использованием вычислительных ресурсов Межведомственного суперкомпьютерного центра Российской академии наук (МСЦ РАН), проект CHPH2. Работа проводилась в рамках государственного задания Минобрнауки, тема 0082-2014-0001, № АААА-А17-117040610310-6.

открыть в PDF формате (на русском языке) (PDF)