English
!

Архив публикаций

Тезисы

XXIII-ая конференция

Локализация "зацентровых" молекул хлорофилла в мономере и тримере фотосистемы 1

Пищальников Р.Ю., Разживин А.П.1

Институт общей физики им. А.М. Прохорова РАН, Россия, 119991, Москва, ул. Вавилова, д. 38, +7(499)503-8783, rpishchal@kapella.gpi.ru

1НИИ физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского МГУ, Россия, 119991, Москва, Ленинские горы, д. 1, стр. 40, НИИФХБ МГУ, +7(495)939-54-13, razjivin@belozersky.msu.ru

1  стр. (принято к публикации)

Проведено моделирование миграции энергии возбуждения в пигмент-белковом комплексе фотосистемы 1 (ФС-1) цианобактерий. Расчеты выполнены для мономерной и тримерной форм ФС-1. Пространственная структура мономера ФС-1 была взята из базы данных белков (Protein Data Bank http://www.rcsb.org/pdb). На основе структуры мономера были проанализированы некоторые варианты формирования тримера ФС-1. Для мономера и тримера рассчитаны экситонные структуры возбужденных состояний. На основе моделирования спектров оптического поглощения, кругового и линейного дихроизма, а также кинетических кривых «накачки-зондирования» были вычислены энергии взаимодействия между молекулами хлорофилла внутри прицентрового комплекса, периферических антенных комплексов Lhca и Psa. Энергии Qy перехода мономерных хлорофиллов были оценены с помощью метода дифференциальной эволюции, являющегося разновидностью генетических алгоритмов поиска оптимальных решений. Процедуры были распараллелены с использованием библиотеки MPI. Вычисления проводились на суперкомпьютере «Ломоносов» МГУ.

В результате анализа теоретических данных были идентифицированы группы молекул хлорофилла, которые соответствуют возбужденным состояниям с энергиями меньше энергии реакционного центра Р700 («зацентровые» формы хлорофилла).

Расчетные данные сравниваются с полученными нами ранее экспериментальными данными для цианобактерии Arthrospira platensis [ 1 ].

Литература

1. Kompanets V. et al. Red chlorophyll excitation dynamics in Arthrospira platensis photosystem I trimeric complexes as studied by femtosecond transient absorption spectroscopy // FEBS Letters Vol. 588, No. 35, 2014, Pp. 341-344.



© 2004 Дизайн Лицея Информационных технологий №1533