English
!

Архив публикаций

Тезисы

XXIII-ая конференция

Структурно-параметрический подход к анализу длинных генетических нуклеотидных последовательностей

Петухов С.В., Степанян И.В., О Хан До, Плешаков К.В., Свирин В.И.

Москва ул. Бардина, 4 пр-т Буденного, 31

1  стр. (принято к публикации)

Структурно-параметрический подход к анализу длинных генетических нуклеотидных последовательностей базируется на геометрической интерпретации их молекулярно-числовых характеристик и позволяет выявить связь молекул ДНК и РНК с фрактальными и иными геометрическими мозаиками, обнаруживает скрытую упорядоченность и помехоустойчивость их визуальных паттернов в ортогональной системе декартовых координат.

Анализ полученных генетических мозаик позволил установить идентифицирующие фрактальные интерпретации геномов различных видов организмов и вирусов. Обнаружено, что диагональные элементы генетических мозаик некоторых различных видов организмов имеют взаимную зеркальную симметрию. Мозаики, в которых отображена информация о внутреннем строении молекулы с учетом последовательности типов водородных связей между парами нуклеотидов имеют выраженный фрактальный характер.

Предлагаемый подход к анализу и моделированию длинных генетических нуклеотидных последовательностей может помочь продвинуться в понимании защитных механизмов иммунной системы при распознавании нуклеотидного состава чужеродных генетических элементов. Дальнейшие исследования возможны на базе разработанного нами геномного браузера, размещенного по адресу http://pentagramon.com для анализа вариантов отображения параметров фрагментов полинуклеотидов на дискретное структурно-параметрическое пространство молекулы.

Литература.

1. Степанян И.В., Петухов С.В The matrix method of representation, analysis and classification of long genetic sequences., – http://arxiv.org/abs/1310.8469 , October 31, 2013.

2. Петухов С.В Концепция резонансов в генетике («резонансная биоинформатика»). – Избранные труды VII Международного конгресса “Слабые и сверхслабые поля и излучения в биологии и медицине”, 07-11 сентября 2015 г., Санкт-Петербург http://www.biophys.ru/lib/sci/resonance/460-resonance-00001

3. Петухов С.В “Вибрационная генетическая биомеханика и наследуемые системы биологических резонансов”, журнал “Медицина и высокие технологии”, 2015, №2, с. 16-28.



© 2004 Дизайн Лицея Информационных технологий №1533