English
!

Архив публикаций

Тезисы

XV-ая конференция

Анализ и моделирование расщепления ДНК ультразвуком

Нечипуренко Д.Ю., Гроховский С.Л., Панченко Л.А., Полозов Р.В., Ильичева И.А., Нечипуренко Ю.Д.

Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН, Россия, 119991, Москва, ул. Вавилова 32, 499 135 10 92, nech@eimb.ru Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова, Физический факультет, Россия, 119899, Москва, Воробьевы Горы, nechidimka@mail.ru Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова, Биологический факультет, Россия, 119899, Москва, Воробьевы Горы Институт теоретической и экспериментальной биофизики, Россия, 142290, Московская область, Пущино, polrob@mail.ru

1  стр.

Анализ картины расщепления молекул ДНК под воздействием ультразвукового облучения водных растворов позволяет выявить структурные и динамические свойства двойной спирали ДНК. Частота разрывов межнуклеотидных связей, возникающих под действием ультразвука, зависит как от типа образующих их нуклеотидов, так и от их ближайших соседей. Нами были получены оценки частот разрывов в каждом из 16 динуклеотидов. Оказалось, что в димерах 5’-d(СрG)-3’, 5’-d(СрА)-3’ и 5’-d(СрТ)-3’ разрывы происходят значительно чаще, чем в остальных, и частота разрывов в ряде случаев существенно зависит от ближайших соседей. Из проведенного статистического анализа следует, что двухспиральные разрывы могут происходить со сдвигом в несколько нуклеотидов. Проанализированы физические предпосылки, которые могут приводить к полученной картине распределения разрывов. Построены алгоритмы и создан пакет программ, позволяющий моделировать внешние механические воздействия на молекулы ДНК и анализировать последствия таких воздействий.



© 2004 Дизайн Лицея Информационных технологий №1533