|
PresentationsElectrostatic interactions of electron transfer proteins in the process of their diffusional encounterMoscow State University, Biological faculty, Biophysics Department, Russia, 119992, Leninskie Gory 1, str. 12 Работа посвящена исследованию процесса образования короткоживущих белок-белковых электрон-транспортных комплексов. При формировании таких комплексов в результате диффузии происходит сближение белков с одновременной пространственной ориентацией за счет электростатических взаимодействий и последующее образование диффузионно-столкновительных комплексов, которые затем могут трансформироваться в финальный комплекс. Однако остается неясным, в какой степени электростатические взаимодействия влияют на скорость образования комплексов белков на различных этапах сближения молекул. В данной работе исследована роль электростатических взаимодействий белков пластоцианина и цитохрома f в процессе формирования ими комплекса методом броуновской динамики. Была исследована зависимость скорости диффузионного сближения реакционных центров двух белков от заданного расстояния между этими центрами при их сближении и проанализировано распределение взаимных ориентаций белков по энергии электростатического взаимодействия. Показано, что электростатические взаимодействия между молекулами белков пластоцианина и цитохрома f при их сближении способствуют занятию энергетически выгодной взаимной ориентации одного белка относительно другого при расстояниях между кофакторами менее 5 нм. Начиная с расстояния 3 нм электростатические взаимодействия приводят к достоверно регистрируемому увеличению скорости сближения кофакторов, при этом энергия электростатического взаимодействия между белками становится сравнимой с kT.
Работа поддержана грантами РФФИ № 15-07-08927, № 15-04-08681, № 14-04-00302.
|
