|
Conference publicationsAbstractsXXIV conferenceMolecular modeling of the photophysical properties of fluorescent proteins based on flavinLomonosov Moscow State University, Russia, 119991, Moscow, Leninske gory 1/3 +74959392035, wasabiko@lcc.chem.msu.ru 1Emanuel Institute of Biochemical Physics RAS, Russia, 119334, Moscow, Kosygina 4 Флуоресцентные белки на основе флавина (FbFP) являются перспективными для исследований in vivo в клетках и тканях и произошли от светочувствительного белка LOV (light, oxygen and voltage sensor). Яркая флуоресценция, не зависящая от присутствия кислорода, небольшой размер белка, а также мономерная форма являются основными достоинствами представителей этого семейства. Недавние исследования показали, что FbFP с улучшенными характеристиками являются альтернативой широко известным белкам семейства GFP. На сегодняшний день разработаны несколько флуоресцентных белков, отличающихся квантовыми выходами флуоресценции и фотостабильностью, однако все они имеют практически совпадающие значения максимумов полос поглощения и флуоресценции. Основываясь на результатах молекулярного моделирования, мы предлагаем новые аминокислотные замены, приводящие к формированию флуоресцентных белков со смещенными положениями максимумов полос поглощения и флуоресценции. В работе применяется комбинированный метод квантовой механики / молекулярной механики для поиска равновесных геометрических конфигураций в основном электронном состоянии, а также для описания конформационной динамики таких систем методом молекулярной динамики с КМ/ММ потенциалами. Для расчета энергий вертикальных переходов применялся многоконфигурационный метод самосогласованного поля в полном пространстве активных орбиталей CASCF с последующим учетом поправок по теории возмущений в варианте XMCQDPT2. Работа поддержана проектом РФФИ 16-03-00078.
|
